mNGS检测呼吸道病原体
1、总而言之,我们利用元基因组测序的持续改进来扩大LRTI诊断急性呼吸系统疾病HCT受者的能力。我们证明,与目前的微生物诊断相比,mNGS具有更大的检测微生物的能力,并且能够将病原体检测与宿主反应和气道微生物组同步分析相结合。
2、mNGS是一种不需培养就可以深入快速鉴定感染病原体的新技术,相比传统培养方法拥有更高敏感性的同时又与“精准诊疗”的理念相契合。临床采集样本类型根据不同病灶分为静脉血、肺泡灌洗液、脑脊液、痰液及其他体液、组织等。
3、若常规核酸检测不能明确病原,推荐采用mNGS进行病原学检测,但其结果需要结合临床表现综合分析,必要时使用其他方法进一步验证。呼吸道病原菌核酸检测可以用于明确患者呼吸道被哪种病原菌感染,以便进行针对性治疗。
4、例如,一项用于鉴定肺炎患者呼吸道病原体的mNGS研究发现,经培养证实感染的个体其呼吸道微生物组的多样性明显较低。
鹦鹉热是什么意思,严重吗
鹦鹉热是一种由鹦鹉热衣原体 (Chlamydia psittaci) 引起的疾病,也称为鹦鹉热病。它是一种常见的鸟类传染病,能够通过空气传播、与鸟体接触和食品污染等途径感染人类。
“鹦鹉热”是一种由弓形虫引起的疾病,也称为鹦鹉病或英国病。人类可以通过和家养鹦鹉接触或摄取被鹦鹉粪便污染的食物或水而感染弓形虫,引发病症,其病症包括发热、咳嗽、头痛、胸痛、关节肌肉疼痛、食欲下降、体重下降等。
“鹦鹉热”是一种人禽共患病,虽然“鹦鹉热”主要在鸟类中流行,但可以感染人类和其他哺乳动物。接触带有病原体或生病的鹦鹉、其他鸟类或家禽,及其分泌物或排泄物污染的环境、羽毛和宰杀病禽均可能被感染。
鹦鹉热也被称为鸟热或鸟疫等,是一种由于鹦鹉热衣原体感染引发的传染性疾病。除了鹦鹉之外,该病还可能在鸭子、鸽子、海鸥、火鸡等多种鸟类之间传播,但是症状表现不如鹦鹉明显。
基于cfDNA的mNGS病原检测
1、mNGS是一种不需培养就可以深入快速鉴定感染病原体的新技术,相比传统培养方法拥有更高敏感性的同时又与“精准诊疗”的理念相契合。临床采集样本类型根据不同病灶分为静脉血、肺泡灌洗液、脑脊液、痰液及其他体液、组织等。
2、mNGS技术适用于病原体鉴定,包括呼吸道感染、血液系统感染和中枢神经系统感染等应用场景。在疾病诊断中,mNGS技术广泛应用于多种疾病的鉴定,尤其是在呼吸道感染、血液系统感染和中枢神经系统感染等方面具有很大的优势。
3、总而言之,我们利用元基因组测序的持续改进来扩大LRTI诊断急性呼吸系统疾病HCT受者的能力。我们证明,与目前的微生物诊断相比,mNGS具有更大的检测微生物的能力,并且能够将病原体检测与宿主反应和气道微生物组同步分析相结合。
4、送检样本质量:mNGS检测限一般为100~1000 copies/ml,如果感染的病原体载量低于mNGS的检测限,则很难检测出来。当样本质量不佳,选取非感染病灶或非原发病灶的标本,无责任病原微生物存在或病原含量低,则容易造成假阴性。
5、mNGS无需靶向扩增。不需预知病原基因组序列信息,因而能够检测包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等在内的所有病原,这就像打仗时的地毯式轰炸。
6、临床mNGS主要关注微生物reads,然而RNA病毒检测的mNGS测序恰巧可以产生宿主RNA-seq分析数据,研究人类宿主感染时的基因表达对病菌感染具有补充作用。
宏基因组(mNGS)简介(一)——临床领域的应用场景
1、短短几年来,宏基因组学的研究已经渗透到各个领域,从海洋到陆地,再到空气,从白蚁到小鼠,再到人体,从发酵工艺到生物能源,再到环境治理等。
2、病毒宏基因组学(Viral metagenomics)就是宏基因组学在病毒领域的应用,即从环境或生物组织中浓缩病毒粒子的遗传物质进行生物学信息分析的技术。
3、快速测试片技术法 快速测试片是指以纸片、纸膜、胶片等作为培养基载体,将特定的培养基和显色物质附着在上面,通过微生物在上面的生长、显色来测定食品中微生物的方法。
如何提高呼吸道病原体核酸检测率专项行动实施方案
1、新冠肺炎疫情防控核酸检测实施办法常态化监测没有发生疫情的地区,严格按照《新型冠状病毒肺炎防控方案》确定的范围对风险岗位、重点人员开展核酸检测,不得扩大核酸检测范围,一般不按行政区域开展全员核酸检测。
2、为顺利开展核酸检测工作,成立核酸检测领导小组,负责组织参检人员有序与医务人员对接(登记组、检测组)开展检测工作。
3、增加集中隔离医学观察期间核酸检测要求。增加集中隔离医学观察期间核酸检测要求,要求对密切接触者和密接的密接集中隔离医学观察期间分别进行3次和1次核酸检测。 中高风险地区最小单元划定。
4、落实员工健康动态监测制度,员工进入场馆一律佩戴口罩,自觉接受体温检测,出现发热、呼吸道症状时,要及时报告。 (七)有序分步开放。各场馆要根据疫情防控实际,分区域分项目逐步恢复开放。
5、出行要求方案指出在沈出行人员,定于4月13日起至4月17日实行居民常态化核酸检测,在沈居民出门都需提供48小时核酸检测阴性报告。其中封控区、隔离区等高风险地区按要求进行核酸检测。